Algunas mujeres pueden tener uno o más síntomas y otras pueden no experimentar  ningún síntoma. Los síntomas emergen debido a que, en la endometriosis, el tejido mal ubicado se transforma en lesiones que responden al ciclo menstrual en forma semejante al revestimiento uterino.

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Así los tejidos endometriales desprenden tejido y fluyen sangre, pero no pueden abandonar el cuerpo, provocando descomposición del material desprendido, ocasionando dolor, cicatrizaciones, adherencias y una serie de problemas que son:

|  Dismenorrea progresiva (periodos dolorosos que empeoran con el tiempo)

|  Dispareunia (dolor durante las relaciones sexuales)

|  Dolor pélvico (dolor general dentro de la pelvis)

|  Infertilidad (problemas para embarazarse)

Con la endometriosis, el dolor durante el periodo usualmente inicia un par de días antes de la menstruación y dura todo el tiempo. Algunas mujeres comentan que también presentan en otros momentos del mes. El dolor durante las relaciones sexuales puede durar algunas horas después de haberlas tenidos.

Algunas mujeres tienen dificultad para embarazarse por que las  relaciones sexuales son dolorosas o la endometriosis ha causado daño a los órganos reproductores. Por ejemplo, los ovarios pueden estar dañados y no pueden liberar el óvulo, o las trompas de Falopio pueden estar obstruidas o dañadas impidiendo que el óvulo sea fertilizado o que llegue a la matriz.

Algunas pacientes también tienen otros síntomas que pueden incluir dolor durante los movimientos intestinales o cuando orinan. En realidad, el sufrir un dolor crónico puede traer como consecuencias cansancio, ausencia de sueño, cambios en el estado de ánimo, depresión, tensión premenstrual (TPM) y dolor en la espalda. 

Los síntomas están relacionados con el sitio de implantación y la severidad de la enfermedad.

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